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Bioinformatique

Code Cours
2324-FGES-COMP-FR-3003
  1. Accueil
  2. Cours
  3. Bioinformatique
Établissement
Faculté de Gestion, Economie & Sciences Licences
Langue d'enseignement
Français, Anglais
Ce cours apparaît dans les formation(s) suivante(s)
Licence Sciences de la Vie - Parcours Biotechnologies - Crédits ECTS:
Responsable(s)
FGES Enseignant à recruter FGES

Présentation

Prérequis

Pour suivre ce cours, l'étudiant doit avoir des connassances en :
- Biochimie
- Biologie moléculaire
- Biotechnologies
- Connaissance du Web

Objectifs
A la fin du cours, l'étudiant devrait être capable d'appliquer des méthodes d'analyse bioinformatique permettant d'extraire les informations utiles d'une séquence d'un génome.
Présentation

Intruduction : la bioinformatique, c'est quoi ?

Chapitre 1 : Les bases de données
Historique; Organisation; Systèmes d'interrogation dédiés (entrez, SRS, entrée SWISS-PROT)

Chapitre 2 : Design d'amorces
Méthodologie et logiciels (NetPrimet; Primer3; PerlPrimer)

Chapitre 3 : Analyses de séquences
Recherche de motifs dans les bases de données; Alignement de séquences par paires ou multiples, Notions de similitude; Systèmes d'interrogation dédiés (BLAST, CLUSTAL ...)

Chapitre 4 : Prédiction et modélisation moléculaire
Utilisation de PDB (Protéine Data Bank); Structure 3D; Phylogénie moléculaire

Modalités

Évaluation
Travaux Pratiques : coeff. 1

Ressources

Bibliographie

Gilbert Deléage et Manolo Gouy, Bioinformatique : Cours et cas pratique, Collection : Sciences Sup, Dunod

Ressources Internet