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Bioinformatique

2016-2017

Faculté de Gestion, Economie & Sciences ( FGES )

Code Cours :

1617-FGES-COMP-FR-3021


Niveau Année de formation Période Langue d'enseignement 
S5Français
Professeur(s) responsable(s)Anne DUMOULIN
Intervenant(s)Pas d'autre intervenant

    Ce cours apparaît dans les formations suivantes :
  • Faculté de Gestion, Economie & Sciences - Licences & Prépas - Licence 3 Sciences de la vie Spécialité Biotechnologies - S5 - 2 ECTS

Pré requis

Pour suivre ce cours, l'étudiant doit avoir des connassances en :
- Biochimie
- Biologie moléculaire
- Biotechnologies
- Connaissance du Web

Objectifs du cours

A la fin du cours, l'étudiant devrait être capable d'appliquer des méthodes d'analyse bioinformatique permettant d'extraire les informations utiles d'une séquence d'un génome.

Contenu du cours

Intruduction : la bioinformatique, c'est quoi ?

Chapitre 1 : Les bases de données
Historique; Organisation; Systèmes d'interrogation dédiés (entrez, SRS, entrée SWISS-PROT)

Chapitre 2 : Design d'amorces
Méthodologie et logiciels (NetPrimet; Primer3; PerlPrimer)

Chapitre 3 : Analyses de séquences
Recherche de motifs dans les bases de données; Alignement de séquences par paires ou multiples, Notions de similitude; Systèmes d'interrogation dédiés (BLAST, CLUSTAL ...)

Chapitre 4 : Prédiction et modélisation moléculaire
Utilisation de PDB (Protéine Data Bank); Structure 3D; Phylogénie moléculaire


Modalités d'enseignement

Organisation du cours

Méthodes pédagogiques


    Évaluation

    Travaux Pratiques : coeff. 1


    Bibliographie

    • Gilbert Deléage et Manolo Gouy, Bioinformatique : Cours et cas pratique, Collection : Sciences Sup, Dunod


    Ressources internet



     
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